怀孕40天时，胚胎正处于器官分化的关键时期，此阶段长时间使用电脑可能会有一定影响，但具体影响因人而异。主要包括以下几方面：
1.电磁辐射：电脑工作时会产生电磁辐射，虽然目前尚无明确证据表明电脑辐射会导致胎儿畸形，但长时间接触可能会对孕妇及胎儿产生不良影响，如孕妇免疫力下降、头痛、疲劳、胎儿发育不良等。
2.血液循环不畅：长期保持坐姿，可能会导致孕妇血液循环不畅，使子宫胎盘的血液循环受到影响，进而影响胎儿的生长发育。
3.精神紧张：面对电脑工作可能会使孕妇精神紧张，压力增大，这对孕妇及胎儿的健康也不利。
鉴于以上因素，建议怀孕40天的孕妇在工作中注意以下几点：
1.穿着防辐射服，减少电磁辐射的影响。
2.每工作1-2小时，起身活动15分钟，以促进血液循环。
3.保持良好的工作环境，定期通风换气，调节室内温度。
4.可在室内摆放一些绿色植物，缓解视疲劳。
5.定期进行产前检查，密切关注胎儿的发育情况。
需要注意的是，每个孕妇的身体状况和胎儿的发育情况都不同，如果孕妇在工作中出现不适或担忧，应及时咨询医生，以便获得更专业的建议。此外，在怀孕前3个月，孕妇应避免接触有害物质，如农药、化学毒物、放射线等，同时应补充叶酸，预防神经管畸形。