射精后小肚子疼可能由生理性原因、精囊炎或前列腺炎导致，需对症治疗。
一、生理性原因：患者在射精时周围肌肉会猛烈收缩，射精后肌肉出现疲劳，就可能有小腹疼痛表现，尤其是性生活较为频繁的患者易出现，通常可自行恢复。
二、精囊炎：
1.这是一种以血精为主要特征的疾病，常有会阴部不适、尿频、尿急、尿痛等局部症状，或发热、恶寒、寒战等全身性症状，常与前列腺炎同时发生。
2.精囊炎患者需做的检查包括精液常规检查、精囊造影、超声波检查、精道造影术等。通过这些检查，医生能明确病因、了解病情，从而制定个体化治疗方案。
三、前列腺炎：
1.主要表现为会阴部放射性疼痛、坠胀，有滴白现象，伴随全身乏力、夜尿多、腰膝酸软、失眠多梦及性功能障碍等。
2.常用治疗细菌感染的前列腺炎的药物有左氧氟沙星、头孢克肟以及阿奇霉素等；非细菌感染导致的前列腺炎可使用盐酸坦索罗辛缓释胶囊治疗。药物使用务必谨遵医嘱。
当患者出现射精后小肚子疼长时间不能缓解的情况时，应及时前往医院检查并对症治疗。
总结提示：文章阐述了射精后小肚子疼的可能原因，包括生理性原因、精囊炎和前列腺炎，并分别对它们进行了详细说明，如生理性原因的具体表现，精囊炎的特征、检查及治疗，前列腺炎的症状和治疗药物等，强调患者若长时间疼痛不缓解应及时就医。