射精时候疼可能由多种原因引起。比如生殖系统炎症是常见因素，像附睾炎，据统计，青壮年男性中约10% - 15%曾患过附睾炎，当附睾发生炎症时，射精过程中肌肉收缩可能刺激炎症部位，导致疼痛；前列腺炎也较为常见，有数据显示，50岁以下男性中约50%会受到前列腺炎困扰，前列腺发炎后，射精时前列腺平滑肌收缩，会引发疼痛。
炎症因素
附睾炎：除了射精疼，还可能伴有阴囊部位的肿胀、疼痛，触摸附睾时能感觉到明显的硬结。一般需要通过医生的体格检查以及超声等检查来明确诊断，治疗上通常需要使用抗生素来消炎，比如常用的左氧氟沙星等，但具体用药需遵医嘱。前列腺炎：除了射精疼，还可能出现尿频、尿急、尿不尽等症状。可以通过前列腺液检查等来确诊，治疗时可能需要根据病情采用抗生素治疗或者物理治疗等方法。
结石问题
尿道结石：如果尿道存在结石，在射精过程中，结石可能会对尿道产生刺激，从而引起疼痛。这类患者可能还会有排尿困难、尿线变细等表现。通过尿道的X线检查或者超声检查可以发现结石，治疗上可能需要根据结石的大小等情况采用尿道镜取石等方法。精囊结石：精囊内如果有结石，射精时精囊收缩，结石刺激周围组织也会导致疼痛。可能需要通过精囊超声等检查来诊断，较小的结石可能暂时观察，较大的结石可能需要手术取出。
性生活相关因素
性生活过于频繁：如果性生活过于频繁，会导致生殖器官反复充血，比如频繁射精后，生殖系统还未完全恢复，再次射精时就可能出现疼痛。一般适当减少性生活频率，让生殖系统有足够的恢复时间，疼痛症状可能会缓解。性生活中动作过于粗暴：在性生活过程中，如果动作过于粗暴，会造成生殖器官的损伤，从而在射精时引起疼痛。这种情况需要注意性生活中的力度，避免过度用力。