甲状腺腺瘤的病因目前尚未完全明确，可能与多种因素相关。一般认为，遗传因素可能在其中起到一定作用，有研究显示部分甲状腺腺瘤患者存在相关基因的异常改变。
一、遗传因素方面
家族遗传倾向： 某些遗传性综合征可能增加甲状腺腺瘤的发病风险。例如，多发性内分泌腺瘤病2型（MEN2）患者，患甲状腺腺瘤的几率相对较高。这类患者往往存在特定的基因缺陷，使得甲状腺细胞更容易发生异常增殖，从而引发腺瘤。
二、激素水平影响
促甲状腺激素刺激： 长期促甲状腺激素（TSH）水平异常升高可能与甲状腺腺瘤的发生有关。当人体长期处于TSH过度刺激的状态时，甲状腺组织受到持续的促生长信号，可能导致甲状腺细胞过度增生，进而形成腺瘤。比如，在地方性甲状腺肿流行地区，由于碘缺乏导致TSH分泌增多，甲状腺腺瘤的发生率相对会有所升高。雌激素的作用： 女性体内雌激素水平的变化可能与甲状腺腺瘤的发生存在关联。研究发现，女性甲状腺腺瘤的发病率相对男性较高，尤其是在育龄期女性中。雌激素可能通过作用于甲状腺细胞上的相关受体，影响细胞的生长和分化，增加腺瘤形成的可能性。
三、环境因素作用
辐射暴露： 颈部受到辐射是甲状腺腺瘤的一个明确危险因素。例如，儿童时期颈部接受过放射性治疗或受到过核辐射，会显著增加日后患甲状腺腺瘤的风险。辐射可以损伤甲状腺细胞的DNA，导致细胞异常增殖，引发腺瘤。据统计，儿童期颈部辐射暴露者，甲状腺腺瘤的发病风险比常人高出数倍。饮食因素： 长期饮食中碘摄入异常也可能与甲状腺腺瘤有关。碘摄入不足或过量都可能影响甲状腺的正常功能和结构。碘摄入不足时，甲状腺会通过代偿性增生来试图摄取更多碘，长期如此可能导致腺瘤形成；而碘摄入过量也可能干扰甲状腺激素的合成与调节，促使甲状腺细胞发生异常变化。