肾结石患者常见的疼痛部位主要有腰部和腹部。一般来说，肾结石引起的疼痛通常是突然发作，疼痛程度较为剧烈。
腰部疼痛方面
肾区隐痛： 当肾结石较小，在肾脏内移动不明显时，患者可能会感到肾区有隐隐的胀痛或酸痛感，这种疼痛可能持续时间较长，时轻时重。比如一些患者会感觉腰部像有东西在牵拉着不舒服。腰部剧烈绞痛： 当肾结石较大，在肾盂或输尿管内移动，造成输尿管梗阻时，就会引发腰部的剧烈绞痛。这种疼痛往往非常难忍，患者会辗转反侧，疼痛可从腰部向同侧下腹部、腹股沟、大腿内侧放射。例如有的患者会从腰部痛到下腹部，像被刀割一样疼。
腹部疼痛相关情况
上腹部疼痛： 如果肾结石位置较高，靠近肾脏上极，疼痛可能会放射到上腹部，类似胃痛的感觉，但又有明显区别。不过这种情况相对较少见，更多还是向下腹部放射。下腹部疼痛： 当结石向下移动，接近输尿管膀胱入口处时，疼痛会明显集中在下腹部。患者可能会感觉下腹部有强烈的疼痛感，同时还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状，因为结石刺激输尿管膀胱壁会引起这些尿路刺激征。
疼痛与结石活动的关系
结石静止时： 部分患者结石处于静止状态，可能没有明显疼痛，或者仅有轻微的腰部酸胀感。但一旦结石开始活动，无论是在肾脏内移动还是向输尿管移动，就很容易引发疼痛。比如结石从肾脏掉到输尿管里，马上就会引起剧烈的疼痛发作。疼痛发作频率： 有些患者可能会反复出现疼痛，比如结石经常移动，就会反复出现腰部或腹部的疼痛。而如果结石固定不动，疼痛可能会暂时缓解，但这并不代表病情好转，只是结石暂时没有刺激到尿路黏膜等结构。