尿毒症晚期呼吸困难的原因主要包括以下几点：
1.心脏功能不全：尿毒症可累及心脏，导致心肌受损、心肌纤维化等，从而影响心脏的收缩和舒张功能，出现心力衰竭。心脏功能不全可导致肺部淤血，影响氧气的交换，引起呼吸困难。
2.酸中毒：尿毒症时，肾脏排泄功能障碍，导致体内代谢产物（如尿素、肌酐等）潴留，引起代谢性酸中毒。酸中毒可影响呼吸中枢，导致呼吸加深加快，出现呼吸困难。
3.电解质紊乱：尿毒症可导致电解质紊乱，如低钠血症、低钾血症等。这些电解质紊乱可影响神经肌肉的兴奋性，导致呼吸肌无力，出现呼吸困难。
4.肺部感染：尿毒症患者免疫力下降，容易并发肺部感染。肺部感染可导致肺泡和肺间质的炎症，影响气体交换，引起呼吸困难。
5.贫血：尿毒症可导致肾脏分泌促红细胞生成素减少，引起贫血。贫血会导致氧气运输障碍，加重呼吸困难。
6.其他：尿毒症晚期还可能出现心包积液、胸腔积液等并发症，也会导致呼吸困难。
针对尿毒症晚期呼吸困难的原因，可以采取以下治疗措施：
1.纠正心脏功能不全：使用利尿剂、强心剂等药物，减轻心脏负荷，增强心肌收缩力。
2.纠正酸中毒：根据酸中毒的程度，给予碱性药物进行纠正。
3.纠正电解质紊乱：根据具体情况，补充或调整电解质。
4.控制肺部感染：使用抗生素进行抗感染治疗。
5.纠正贫血：补充铁剂、叶酸等造血原料，或使用促红细胞生成素。
6.其他治疗：如透析治疗、肾移植等，以改善尿毒症症状。
此外，尿毒症患者在日常生活中应注意休息，避免劳累和感染，保持良好的营养状态，积极配合治疗，以提高生活质量，延长生存期。