HPV主要通过性传播，有研究显示，在有性生活的人群中，约有一半会在一生中感染HPV。
性传播途径：
皮肤黏膜直接接触： HPV主要存在于感染者的生殖道皮肤黏膜上，性行为时，皮肤黏膜直接接触就可能导致病毒传播。比如没有采取安全措施的阴道性交、肛门性交等，都容易让HPV从一方传播到另一方。口交传播： 口与生殖器的接触也可能引发HPV在口咽部的感染，虽然相对阴道和肛门性交传播的概率可能稍低，但也是传播途径之一。
密切接触传播：
间接接触污染物品： 少数情况下，接触了被HPV污染的物品，比如共用毛巾、浴盆等。不过这种传播方式比较少见，因为HPV离开人体后存活时间较短，而且需要一定条件才能感染新的宿主。但如果皮肤有破损，接触到污染物品就有被感染的可能。母婴传播： 母亲在分娩过程中，如果产道有HPV感染，新生儿通过产道时可能会被感染，引发喉部乳头瘤等疾病，但这种情况发生的概率较低。
其他可能途径：
医源性传播： 在医疗操作中，如果医疗器械消毒不彻底，也有可能造成HPV的传播，但这种情况非常罕见，目前临床上通过严格的消毒措施已经大大降低了这种风险。不过在一些不正规的医疗场所，还是存在一定隐患。