怀孕了发现有霉菌主要是指孕期外生殖器感染霉菌。因为女性在孕期身体免疫力会有所下降，容易引发阴道菌群失衡，进而导致霉菌感染。而当发现霉菌感染后，可通过如下方式来处理。
一、药物：
1.在怀孕期间如果出现霉菌感染，必须在医生指导下，选用对孕妇和胎儿安全的药物进行治疗。
2.孕妇感染霉菌后，可遵医嘱应用克霉唑栓剂、制霉菌素阴道泡腾片等药物，以抑制霉菌繁殖，减轻瘙痒症状。
二、注意个人清洁：
1.孕期霉菌感染可能源于不良的卫生习惯或不恰当的清洁方式，所以在患病和治疗期间，孕妇要注重保持外阴清洁。
2.每天使用清水进行清洁，并且定期更换干净内裤，这样可防止病情加重。
三、改善日常生活方式：
1.女性在孕期由于激素变化会使身体免疫力下降，所以在孕期适当进行体育锻炼是很有必要的。
2.这能够在一定程度上提升身体抵抗力和免疫力，对疾病治疗能起到良好的辅助作用。
此外，怀孕发现有霉菌还可能出现在皮肤感染、尿道炎等情况，此时建议在医院完善相关检查，而后在医生指导下，依据具体感染部位和孕妇身体状况实施针对性治疗。
总之，孕期发现霉菌感染后要及时采取合适的措施进行处理和应对，以保障孕妇自身和胎儿的健康。