宝宝睡醒后咳嗽常见原因包括：
一、睡眠时人体以迷走神经支配为主，对诸多刺激不敏感，致使气道易堆积分泌物，觉醒后交感神经兴奋，就会因感受到这类分泌物而出现咳嗽。在睡眠状态下，身体的神经系统会发生一些变化。迷走神经相对活跃，这会使得身体对于一些外界刺激的反应性降低。这样一来，气道内的分泌物可能会逐渐积聚而未被及时清理。当宝宝睡醒后，交感神经开始占据主导地位，此时就会明显感觉到气道内的这些分泌物，从而引发咳嗽反应。
二、部分宝宝可能存在呼吸道感染，鼻涕较多，睡眠时鼻涕倒流至咽部，刺激咽部后会在睡醒时有较明显咳嗽。宝宝如果有呼吸道感染，会产生较多的鼻涕。在睡觉时，这些鼻涕可能会顺着鼻腔向后流到咽部。当宝宝醒来后，就会因为咽部受到刺激而出现比较明显的咳嗽症状。
三、有些宝宝可能有过敏性咳嗽问题，往往在晨起或夜间有较明显刺激性干咳。对于存在过敏性咳嗽的宝宝，可能会在特定的时间段，比如早晨刚醒来或者夜间，出现较为明显的刺激性干咳。这是由于过敏因素导致气道处于高敏感状态，容易受到一些轻微刺激就引发咳嗽。
四、气道高反应，宝宝醒来后呼吸相对加快，吸入空气流量较睡觉时增多，从而刺激气管发生高反应状态，出现咳嗽现象。当宝宝从睡眠状态苏醒后，呼吸的频率和深度可能会有所增加。这样就会导致吸入的空气流量比睡眠时多。对于气道较为敏感的宝宝来说，这可能会引发气管的高反应状态，进而导致咳嗽的出现。
若宝宝长期睡醒后咳嗽，需警惕发生下呼吸道感染或处于过敏状态，应及时就医明确病因并进一步治疗。总之，宝宝睡醒后咳嗽的原因多样，需要仔细观察和分析，以便准确诊断和采取合适的治疗措施。