三个月的宝宝晚上哭闹，其原因可能涉及环境、吃奶、大小便、疾病等方面，需具体分析以明确原因，并针对病因采取相应处理措施。
一、环境：
1.过冷或过热会让宝宝体感不适而哭闹，需注意调节室内温度。
2.睡觉时挤压到宝宝也可能引发哭闹，要保证宝宝有舒适的睡眠空间。
3.周围接触环境太过空旷会使宝宝缺乏安全感而哭闹，要营造适宜的睡眠氛围。
二、吃奶：
1.晚上宝宝饥饿会导致哭闹，应及时喂养。
2.喂养后不能急于平放孩子，需拍拍嗝，并让孩子保持头高足低体位睡觉，这样可减少呕吐情况。
三、大小便：
1.宝宝大小便后若没有及时清理，会因臀部不适而突然哭闹，要及时检查尿不湿内部状况。
2.保持宝宝臀部清洁干燥，可增加其舒适度。
四、疾病：
1.颈部、腋窝、腹股沟区等因皮肤潮湿导致破溃感染，会使宝宝异常哭闹，此时需在医生指导下外用抗生素软膏，并时常使潮湿部位透气。
2.因大便较稀导致红臀等，会因患处疼痛而哭闹，也需要外用抗生素或保护皮肤的软膏进行治疗。
3.肠炎、嵌顿疝、包皮炎、骨折脱位等会因患处疼痛而哭闹，需针对具体情况给予保守或手术治疗。
4.机体缺乏钙锌等元素时，也可能导致夜间哭闹，要在医生指导下补充微量元素。
家长应重视日常精心护理，当宝宝不明原因异常哭闹时，要及时带其去医院就诊。总之，对于宝宝晚上哭闹的情况，要仔细观察和分析，以便采取恰当的措施来缓解。