腺肌症的治疗需根据患者年龄、症状、生育需求等综合判断，一般可以通过药物治疗、手术治疗、聚焦超声治疗等方式来处理。对于症状较轻、有生育需求或近绝经期的患者，药物治疗是一种选择。常用药物如非甾体抗炎药，能在一定程度上缓解痛经等症状，但通常不能根治疾病，且可能有胃肠道不适等副作用。
药物治疗方面
短效避孕药： 部分患者服用短效避孕药后，能使月经量减少，痛经症状得到改善，但一般需要连续服用3 - 6个月。不过，有静脉血栓风险的人群不适合使用这类药物。GnRH - a类药物： 可以抑制卵巢功能，降低雌激素水平，使异位的子宫内膜萎缩。不过，长期使用可能会导致骨质丢失等问题，一般使用时间不超过6个月。
手术治疗情况
子宫腺肌瘤剔除术： 适用于年轻、有生育需求的患者，通过手术将子宫肌层内的腺肌瘤切除，但术后有复发的可能，复发率大概在10% - 30%左右。子宫切除术： 对于无生育需求、症状严重且药物治疗无效的患者，可以考虑子宫切除。这是根治腺肌症的方法，但会丧失生育能力，术后要注意身体的恢复。
聚焦超声治疗情况
原理： 利用超声波聚焦于体内的病灶处，使病灶组织发生凝固性坏死，从而达到治疗腺肌症的目的。治疗过程中患者痛苦相对较小，术后恢复较快，一般治疗后1 - 3个月症状会逐渐改善，但对于较大的病灶，可能需要多次治疗。不过，有超声聚焦禁忌证的患者不能采用这种方法。