肛门湿疹通常难以完全根治，可通过如下方式进行医治，同时还需注重预防复发。治疗时要信任医生，保持良好心态，避免恐惧、焦虑与迷信，因为科学治疗与良好心态对治疗成功极为重要。
一、一般治疗
1.找出并远离过敏原是湿疹治疗的关键举措之一，日常生活中要注意保持皮肤表面清洁。
2.减少对患处的抓挠。
3.适当使用具有保湿润肤功效的护肤产品。
二、外用药物治疗
1.湿疹的外用药物主要有三类，其中一类主要用于控制炎症，如局部外用的糖皮质激素。
2.一类主要用于抑制免疫系统功能，如免疫抑制剂。
3.还有一类可用于控制感染症状，如外用抗生素软膏。
三、口服药物治疗
1.湿疹的口服药物包括西替利嗪、氯雷他定等抗组胺药。
2.还包括维生素C等。
此外，还需注意以下方面：适度运动可预防湿疹，每天坚持30分钟的有氧运动，像是跑步、游泳、打太极拳等，能增强免疫力以预防湿疹。保持心情愉悦有助于预防湿疹，避免紧张、抑郁、焦虑、暴躁等负面情绪，要学会释放精神压力，例如听舒缓音乐、泡热水澡、做瑜伽、冥想等。养成健康饮食习惯也能预防湿疹，避免偏食，减少食用容易引起过敏的食物以及辛辣刺激食物，如海鲜、辣椒、酒、牛、羊肉、咖啡等。
总之，对于肛门湿疹要综合采取多种治疗和预防措施，以提高治疗效果和减少复发几率。