小儿口腔溃疡可以使用一些局部药物来缓解症状，比如西瓜霜喷剂，一般用药后能在一定程度上减轻疼痛、促进溃疡愈合。
局部外用药物
西瓜霜喷剂：具有清热解毒、消肿止痛的作用，能对小儿口腔溃疡起到一定的治疗效果，直接喷于患处即可。但要注意，给小儿使用时动作要轻柔，避免引起不适。冰硼散：也是常用的治疗口腔溃疡的药物，有清热解毒、消肿止痛的功效，可将其薄薄地涂于溃疡面上，但小儿可能会因味道等原因不太配合。
促进愈合类药物
重组人表皮生长因子凝胶：能促进皮肤与黏膜创面的愈合，对于小儿口腔溃疡有一定的促进愈合作用。使用时需清洁口腔后，用棉签取适量凝胶涂于溃疡处。不过，2岁以下小儿使用需谨慎，最好在医生指导下应用。康复新液：可以内服也可以外用，外用时用医用纱布浸透药液后敷于口腔溃疡创面，能加速创面愈合。小儿使用时要注意避免误咽。
补充维生素类
维生素B2：小儿口腔溃疡有时可能与缺乏维生素B2有关，适当补充维生素B2可能有助于溃疡的恢复。可以通过食物补充，如多吃富含维生素B2的食物，像牛奶、动物肝脏、绿叶蔬菜等，但如果需要药物补充，要在医生指导下使用，因为过量补充可能会有不良反应。复合维生素B：含有多种B族维生素，也能在一定程度上预防和辅助治疗因维生素缺乏引起的口腔溃疡。同样要注意按照医生建议的剂量给小儿服用。需要注意的是，小儿口腔溃疡时，除了用药，还应让小儿保持口腔清洁，饭后让小儿漱口，饮食要清淡，避免吃辛辣、刺激性强的食物。如果小儿口腔溃疡持续时间较长、反复发作或伴有其他症状，如发热、拒食等，应及时带小儿就医，查明原因，在医生的指导下进行规范治疗，不要自行盲目给小儿使用过多药物。