慢性前列腺炎的药物治疗需根据具体类型选择，一般来说，抗生素是治疗细菌性慢性前列腺炎的常用药物，如左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素，通常需要服用2~4周左右。
抗生素类药物
细菌性慢性前列腺炎：主要用抗生素治疗，像左氧氟沙星属于喹诺酮类抗生素，能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而杀菌，一般需服用2 - 4周。还有头孢菌素类抗生素，如头孢克肟，通过破坏细菌细胞壁来杀菌，也可用于细菌性慢性前列腺炎的治疗。
α-受体阻滞剂
改善排尿症状： α-受体阻滞剂能松弛前列腺和膀胱颈部平滑肌，缓解排尿困难等症状。常用的有坦索罗辛，它可选择性阻断α₁肾上腺素受体，降低膀胱颈及前列腺部尿道阻力，一般建议长期服用，可改善患者尿频、尿急、尿痛等症状。还有赛洛多辛，同样能阻断α₁肾上腺素受体，起效较快，对缓解慢性前列腺炎相关的排尿不适有帮助。
非甾体抗炎镇痛药
缓解疼痛不适： 对于有疼痛症状的慢性前列腺炎患者，非甾体抗炎镇痛药可减轻疼痛和炎症。如布洛芬，通过抑制环氧化酶活性，减少前列腺素合成，发挥抗炎、镇痛作用。双氯芬酸也是常用的非甾体抗炎药，能有效缓解慢性前列腺炎引起的会阴部、耻骨上区等部位的疼痛不适。
植物制剂
辅助治疗作用： 一些植物制剂也可用于慢性前列腺炎的辅助治疗。比如锯叶棕果实提取物，它具有抗炎、减轻尿道黏膜水肿等作用，能改善慢性前列腺炎患者的排尿症状和疼痛症状。还有沙巴棕软胶囊，可抑制前列腺增生，减轻前列腺炎相关的不适，对缓解尿频、夜尿增多等情况有一定帮助。