HPV早期通常没有明显症状，部分人可能会有生殖器部位的异常表现。比如，女性可能在宫颈部位出现一些细微变化，但一般很难自行察觉。
HPV早期皮肤表现
寻常疣： 表现为突出皮肤表面的小疙瘩，质地较硬，颜色与皮肤相近或偏灰，大小不一，有的如米粒般大小，有的可能稍大些，可发生在身体任何部位，多是因为皮肤破损后HPV感染所致。扁平疣： 一般是扁平的小丘疹，表面光滑，颜色多为浅褐色或正常肤色，通常成群出现，好发于面部、手背等部位，青少年较为常见。
HPV早期生殖器表现
男性生殖器表现： 可能在阴茎、阴囊等部位出现小的丘疹、乳头状或菜花状的赘生物，初期可能比较小，不易被发现，随着病毒持续感染可能会逐渐增大增多。女性生殖器表现： 女性可能在大小阴唇、宫颈、阴道等部位出现类似男性的赘生物，也可能没有明显的赘生物，而是宫颈部位出现一些细胞学的异常改变，但自身可能没有特殊不适感觉。
HPV感染的潜在风险
持续感染风险： 大部分人感染HPV后是一过性的，身体能自行清除病毒，但有约5% - 10%的人会发生持续感染，若持续感染高危型HPV，就可能增加患宫颈癌等疾病的风险，不过这个过程可能需要数年甚至更长时间。与其他疾病关联： 除了可能引发生殖器疣和增加宫颈癌等癌症风险外，高危型HPV持续感染还可能与肛门癌、口咽癌等其他部位的癌症相关，但相对来说比较少见。