有胎心胎芽但孕酮低且未及时补充时，有胎停的可能，不过并非一定会胎停，这具体和孕酮低的程度有关，要点如下：
一、怀孕早期孕酮正常范围通常要大于25nmol/L。
1.如果检查发现孕酮值小于25nmol/L但超过20nmol/L，只是稍低于正常值，且有胎心胎芽，也没有腹痛、阴道出血等症状，那么胎停的风险相对较小。
2.胎停一般发生在怀孕三个月内，其中怀孕8周左右是胎停的高发时期，占孕期胎停的80%。胎芽通常出现在怀孕6-7周，胎心出现在怀孕7-8周。
二、即使有胎心胎芽，但若孕酮过低，不足10nmol/L，还伴有腹痛、阴道出血表现，且没有及时补充孕酮进行保胎治疗，那么胎停育的风险就会较高。
总之，有胎心胎芽时孕酮低的情况不能一概而论地认为一定会胎停，需要综合孕酮具体数值、是否有相关症状等多方面因素来判断。