幼儿急疹主要是由人类疱疹病毒6型（HHV-6）引起的，约占幼儿急疹病因的90%，另外人类疱疹病毒7型（HHV-7）也可引起，占比约10%左右。
病毒感染是主因
人类疱疹病毒6型： 这是引发幼儿急疹最常见的病原体，多发生在6~18个月的婴幼儿身上。病毒主要通过唾液传播，当健康儿童接触到被病毒污染的唾液时，就有可能被感染。人类疱疹病毒7型： 它引起幼儿急疹的情况相对人类疱疹病毒6型少一些，但同样会导致幼儿出现发热、出疹等类似幼儿急疹的症状，传播途径与人类疱疹病毒6型类似，也是通过密切接触传播，比如和患病幼儿一起玩耍、亲吻等都可能感染。
免疫系统发育不完善易发病
幼儿的免疫系统还处于发育阶段，抵御病毒的能力较弱。在接触到人类疱疹病毒6型或7型后，身体的免疫反应需要一定时间来启动，这就使得病毒有机会在体内大量繁殖，从而引发幼儿急疹。一般来说，6个月以后的婴儿从母体获得的抗体逐渐减少，自身免疫系统又还没完全建立起来，所以这个年龄段的幼儿更容易患上幼儿急疹。
环境因素增加感染风险
人群密集场所： 像幼儿园、游乐场等人群密集的地方，病毒传播的几率大大增加。因为在这些场所中，幼儿之间密切接触的机会较多，病毒很容易在幼儿群体中传播开来。例如，一个患病幼儿呼出的带有病毒的飞沫会在空气中传播，其他幼儿吸入后就可能被感染。卫生条件较差的环境： 如果生活环境的卫生条件不好，比如居住环境不通风、玩具等物品没有及时清洁消毒，也会增加幼儿感染人类疱疹病毒6型或7型的风险。不清洁的环境容易滋生病毒，让幼儿接触到病毒的机会增多。