脚气难以除根主要是因为引发脚气的真菌容易在适宜环境中存活和繁殖。比如，真菌喜欢温暖潮湿的环境，人的脚部长期处于鞋袜包裹的状态，就为真菌提供了这样的温床。
真菌的生存特性
顽强的生存能力： 引起脚气的真菌可以在皮肤表面、鞋袜甚至地板等环境中存活较长时间。它们能耐受一定的干燥环境，在干燥的环境中也能存活数周甚至数月，一旦遇到合适的湿度和温度，就会再次感染人体。繁殖速度快： 在合适的条件下，真菌会快速繁殖。一个真菌孢子可以在短时间内繁殖出大量的菌丝体，从而导致脚气症状反复发作。比如在温暖潮湿的季节，真菌的繁殖速度会明显加快，脚气也更容易加重或复发。
不良生活习惯的影响
脚部环境难改善： 很多人习惯长时间穿着不透气的鞋子，像塑料鞋、不透气的皮鞋等，这会使脚部处于闷热潮湿的环境，为真菌滋生创造了极佳条件。而且，不经常更换鞋袜，脚部的汗液和皮屑等会成为真菌的营养来源，进一步促进真菌生长，导致脚气难以彻底消除。接触感染源易复发： 脚气具有传染性，人们很容易再次接触到真菌。比如在公共浴室、游泳池、更衣室等场所，接触到被真菌污染的地面、毛巾、拖鞋等，就可能再次感染脚气。即使之前的脚气症状看似好了，但如果再次接触到真菌，又会引发脚气。
治疗不彻底的因素
用药不规范： 一些人在治疗脚气时，看到症状减轻就自行停药，没有按照疗程用药。这样往往不能完全杀灭真菌，残留的真菌会在适宜条件下再次活跃，导致脚气复发。例如，使用抗真菌药物治疗脚气时，一般需要连续使用2 - 4周甚至更长时间才能彻底清除真菌，如果中途过早停药，很容易复发。未同时处理相关物品： 患者在治疗脚气时，只关注脚部的治疗，而忽略了对鞋袜、洗脚盆、毛巾等物品的消毒处理。真菌可能会残留在这些物品上，当再次接触脚部时，又会引起脚气复发。所以，即使脚部的真菌被暂时杀灭，如果不处理相关物品，脚气还是容易再次出现。