肛门肿痛可能由多种原因引起。比如，血栓性外痔是常见原因之一，通常是肛门周围皮下静脉破裂出血，形成血栓，一般在排便或剧烈活动后突然发生，疼痛较为剧烈，可摸到肛门处有暗紫色圆形硬结。
肛肠疾病导致的肛门肿痛
肛周脓肿： 多因肛腺感染引起，常表现为肛门周围持续疼痛，逐渐加重，病变处有红肿、压痛，严重时可伴有发热、寒战等全身症状。一般脓肿形成后需要及时就医处理。肛裂： 主要是肛管皮肤全层裂开形成的小溃疡，排便时会出现剧烈疼痛，便后有短暂缓解，随后又会出现长时间的疼痛，同时伴有便血，便血颜色鲜红，量一般较少。
感染性因素引发的肛门肿痛
肛窦炎： 肛窦受细菌感染引发炎症，会出现肛门部坠胀感，排便时疼痛加重，可伴有少量黏液排出，黏液可刺激肛门周围皮肤，引起瘙痒。直肠炎： 直肠发生炎症时，也可能导致肛门肿痛，多伴有腹泻、里急后重（总有排便不尽的感觉）等症状，炎症刺激直肠黏膜，可引起肛门周围不适。
其他因素造成的肛门肿痛
异物刺激： 如肛门内误入鱼刺、木屑等异物，会引起肛门局部的肿痛，通常有异物进入肛门的明确诱因，能感觉到肛门处有异物感且伴有疼痛。过敏反应： 对某些食物、药物或卫生巾等过敏，也可能导致肛门周围出现肿痛、瘙痒等症状，一般有明确的接触过敏物质的病史，停用相关过敏物质后症状可能会逐渐缓解。