克霉唑栓和保妇康栓在多个方面存在差异。
一、成分方面：
1.克霉唑栓属于西药，其主要成分就是克霉唑。
2.保妇康栓是中成药，主要成分包括莪术油和冰片。
二、功能主治方面：
1.克霉唑栓是广谱抗真菌药，对众多真菌尤其是白色念珠菌有抗菌作用，通常主要应用于念珠菌性外阴阴道炎。
2.保妇康栓具有行气破瘀、生肌止痛的功效，适用于湿热瘀滞所导致的带下病，比如带下量多、色黄，有时阴部瘙痒等，在临床上多用于治疗霉菌性阴道炎、老年性阴道炎等，其适用范围相对更广一些。
总之，克霉唑栓和保妇康栓因成分不同导致在功能主治上存在差异，在使用时需根据具体病情选择合适的药物。