小便刺痛可能由多种原因引起。一般来说，泌尿系统感染是导致小便刺痛比较常见的原因，比如尿道炎，在女性中发病率相对较高，大约有30%左右的女性在一生中会遭遇至少一次尿道炎发作，从而出现小便刺痛等症状。
泌尿系统感染引发小便刺痛
尿道炎： 除了小便刺痛，还可能伴有尿频、尿急等症状。致病微生物主要有大肠杆菌等，性生活不注意卫生等因素容易诱发尿道炎。膀胱炎： 除了小便刺痛，可能会有下腹部疼痛不适，尿液可能会浑浊，女性在经期卫生不佳时较易患上膀胱炎。
泌尿系统结石导致小便刺痛
肾结石： 除了小便刺痛，可能会有腰部隐痛或绞痛，当结石移动时疼痛可能会加剧，部分患者还会出现血尿。输尿管结石： 小便刺痛的同时，疼痛可能会向会阴部放射，患者可能会出现恶心、呕吐等症状，结石较小的情况下可能会随尿液排出。
其他可能原因
前列腺炎： 多见于男性，除了小便刺痛，还可能有会阴部坠胀感、尿频、尿急等表现，长期久坐、酗酒等不良生活习惯容易引发前列腺炎。尿道损伤： 比如性生活过于粗暴、外力撞击等导致尿道损伤，会出现小便刺痛，同时可能有尿道出血等情况。