一般情况下，肛门边长肉疙瘩且很痛可通过以下几种方法治疗：外用药物、口服药物、手术。具体如下：
一、外用药物：若肛门边长了肉疙瘩且很痛，患者需尽量避免用手抓挠或触碰。可在医生指导下外用九华膏，其能起到消肿止痛、生肌收口等作用，有助于缓解症状；硝酸咪康唑乳膏可用于治疗因真菌感染导致的相关情况；复方醋酸地塞米松乳膏能起到抗炎、抗过敏等效果，利于肉疙瘩的改善。
二、口服药物：患者在外用药物同时，还需遵医嘱口服湿毒清胶囊，能起到养血润燥、祛风止痒等作用，对病情改善有益；布洛芬缓释胶囊有止痛功效，可减轻疼痛不适；阿奇霉素片可起到抗菌消炎的效果，利于身体恢复。
三、手术：倘若通过外用药物和口服药物无法有效改善肛门边长肉疙瘩且很痛的状况，患者应及时前往医院，在医生指导下根据实际情况通过手术进行治疗，如混合痔切除术、内痔胶圈套扎术等。
总之，对于肛门边长肉疙瘩且很痛的情况，要根据具体病情选择合适的治疗方法，同时患者要注意日常护理，保持肛门清洁等。