尿道结石的形成与多种因素相关。一般来说，尿液中某些物质浓度过高、尿道局部存在梗阻等情况都可能促使尿道结石形成。
尿液成分异常相关因素
尿液中晶体物质过饱和：例如尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等晶体物质含量过高，当达到一定浓度时，就容易从尿液中析出形成结晶，进而逐渐聚集成结石。比如，长期高钙饮食的人，尿液中钙的含量可能会升高，增加尿道结石形成风险。尿pH值改变影响晶体溶解：不同的晶体物质在不同pH值的尿液中溶解度不同。如果尿液pH值发生变化，就可能影响晶体的溶解状态。像尿酸结石在酸性尿液中容易形成，而磷酸镁铵结石则在碱性尿液中更易形成。
尿道局部因素
尿道狭窄：当尿道存在狭窄时，尿液排出不畅，尿液中的晶体物质等容易在狭窄部位沉积，逐渐形成结石。比如先天性尿道狭窄或者尿道外伤后形成瘢痕导致的狭窄，都可能引发尿道结石。尿道有异物：如果尿道内存在外来异物，如尿道内曾经放置过导管等，异物会成为晶体附着的核心，促使结石形成。尿液中的晶体物质会围绕异物沉积，最终形成尿道结石。
代谢性因素
甲状旁腺功能亢进：甲状旁腺功能亢进会使体内钙代谢紊乱，导致血钙升高，进而使尿液中钙的排出量增加，增加尿道结石形成的可能性。患者血液中甲状旁腺激素水平异常升高，影响了钙的平衡。痛风患者：痛风患者体内尿酸代谢异常，血尿酸升高，尿液中尿酸含量增加，容易形成尿酸结石。痛风患者由于嘌呤代谢障碍，导致尿酸生成过多或排泄减少。