前列腺包膜存在一层脂质，这对部分药物会形成一定的屏障作用，致使多数抗生素难以进入前列腺组织以实现杀菌目的。故而能穿透前列腺包膜的药物通常需具备良好的脂溶性，常见的有喹诺酮类、大环内酯类、磺胺类等药物。这些药物常被用于慢性细菌性前列腺炎的治疗，不过18岁以下青少年以及65岁以上老年人禁用。
一、喹诺酮类药物：包含左氧氟沙星、莫西沙星、氧氟沙星、环丙沙星、加替沙星等。这类药物属于广谱抗生素，抗革兰阴性菌活性很强，可用于多种耐药菌的医治；
二、大环内酯类药物：涵盖红霉素、阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素等，主要用于医治需氧的革兰阳性球菌、革兰阴性球菌以及支原体、衣原体等病原体感染，属于快速抑菌剂；
三、磺胺类药物：有复方新诺明、柳氮磺吡啶等，是传统的抗男性生殖系感染药物，属于广谱抗生素，对多数革兰阳性菌、革兰阴性菌及衣原体具有抑制和杀灭作用；
四、四环素类药物：包括米诺环素、多西环素等，属于广谱抗生素，对革兰氏阴性需氧菌和革兰氏阴性厌氧菌、立克次氏体、螺旋体等病原体具有抑制和杀灭功效；
五、其他药物：部分头孢菌素类药物，例如头孢地尼、头孢克洛等，以及部分特殊抗生素，如万古霉素、利福平等，也具有穿透前列腺包膜的效果，可用于慢性前列腺炎的治疗，其中头孢菌素和利福平是广谱抗生素，万古霉素是窄谱抗生素。临床上多数慢性前列腺炎属于慢性非细菌性前列腺炎，此类患者主要以对症治疗为主，通常无需使用抗生素进行治疗。常用药物有α受体阻滞剂，如哌唑嗪、特拉唑嗪、阿夫唑嗪，或者β2受体激动剂，包括沙美特罗、福莫特罗等。
总之，前列腺包膜的特性使得某些药物能穿透它，这些药物在慢性细菌性前列腺炎治疗中有重要作用，但存在使用禁忌人群，而慢性非细菌性前列腺炎以对症治疗为主。