传染性软疣相对好治疗，通常可以通过局部治疗等方法改善。一般来说，经过规范处理，多数患者能较快康复。
局部治疗方法
镊子夹除： 医生会用镊子将软疣小体完全夹出，这是比较常用的方法。操作时要注意消毒，避免感染。一般夹除后，局部涂抹碘伏等进行消毒即可。刮除术： 用刮匙将软疣刮除，然后再进行消毒处理。这种方法适用于较大的软疣。
药物辅助治疗
抗病毒药物： 对于一些情况特殊的患者，可能会使用抗病毒药物辅助治疗。比如外用的干扰素凝胶等，有一定的抗病毒作用，但一般不作为主要的治疗手段，多是配合局部治疗使用。
注意事项
避免搔抓： 患者要注意避免搔抓疣体，以免引起自身接种，导致皮疹增多。因为搔抓后病毒可能会传播到身体其他部位，使得更多部位出现传染性软疣。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，勤换衣物。患者使用过的衣物、毛巾等要进行消毒处理，防止传染给他人。比如可以用开水烫洗衣物等。公共场所注意： 在公共泳池、浴室等场所要注意防护，避免接触传染源。因为传染性软疣可以通过接触传播，在这些公共环境中容易感染。