霉菌性龟头炎主要由白色念珠菌等真菌感染引起，常用的治疗药物有局部外用药物和口服药物。一般来说，局部外用抗真菌药物较为常用，比如可以使用克霉唑乳膏，它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。
局部外用药物治疗
克霉唑乳膏： 属于广谱抗真菌药，直接涂抹在龟头患处，能有效抑制真菌的生长繁殖。一般每天涂抹2 - 3次，连续使用一段时间。使用时要注意保持龟头局部清洁干燥。咪康唑乳膏： 通过干扰真菌细胞的代谢过程来发挥抗真菌功效，同样是外用，涂抹于龟头病变部位，每天早晚各一次。在涂抹前需清洁龟头，避免局部有过多污垢影响药效。
口服抗真菌药物
氟康唑： 是一种口服的广谱抗真菌药，对于霉菌性龟头炎也有较好的治疗效果。它能抑制真菌的DNA合成和复制，从而达到杀菌作用。不过，口服药物需要在医生的指导下使用，因为它可能会有一些不良反应，比如可能对肝脏有一定影响，所以用药期间需要定期监测肝功能。伊曲康唑： 也是常用的口服抗真菌药物，它可以高度选择性地抑制真菌细胞的细胞色素P450酶，从而阻断真菌细胞膜麦角固醇的合成，发挥抗真菌作用。但同样要注意其可能存在的不良反应，像胃肠道不适等情况。
治疗中的注意事项
个人卫生方面： 患病期间要保持龟头部位的清洁，每天用清水清洗龟头，清洗时要轻轻翻动包皮，清除包皮垢。清洗后要及时擦干，保持干燥，因为潮湿的环境容易滋生真菌，不利于病情恢复。避免性生活： 在霉菌性龟头炎治疗期间应避免性生活，以免将真菌传染给性伴侣，同时也防止性生活刺激加重龟头炎症。如果性伴侣也有相关症状，最好一起进行检查和治疗。停药与复查： 一般在用药一段时间后，比如使用外用药物1 - 2周左右，需要到医院进行复查，了解病情恢复情况。如果症状没有明显改善或者反复发作，可能需要调整治疗方案。