怀孕三个月时出现阴道出血，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕前三个月，胎盘尚未发育成熟，胚胎与子宫壁的连接还不紧密，如果此时过度劳累、性生活不当或精神压力过大，可能导致子宫收缩，引起阴道出血。此外，孕妇患有全身性疾病，如严重的贫血、高血压、慢性肾炎等，也可能导致先兆流产。如果出血量较少，没有腹痛等不适，可以通过卧床休息、补充孕激素等方式进行保胎治疗。如果出血量较多，伴有明显腹痛，应及时就医，必要时进行清宫手术。
2.宫颈息肉：怀孕期间，孕妇体内激素水平升高，可能导致宫颈息肉的形成。宫颈息肉质地脆弱，容易破裂出血，表现为阴道少量出血。如果确诊为宫颈息肉，且息肉较大，影响孕妇健康，应在医生的指导下进行手术切除。
3.前置胎盘：前置胎盘是指胎盘下缘部分或完全覆盖宫颈内口，随着孕周的增加，子宫下段逐渐伸展，前置的胎盘可能发生错位，引起血管破裂，导致阴道出血。前置胎盘引起的出血通常发生在孕晚期或临产后，出血量较多，且难以控制。孕妇应绝对卧床休息，密切监测胎儿情况，必要时需提前终止妊娠。
4.其他原因：孕妇在怀孕期间，如果患有阴道炎、宫颈炎等妇科炎症，也可能出现阴道出血。此外，孕妇接触有害物质、服用致畸药物等，也可能导致胎儿发育异常，引起阴道出血。
总之，怀孕三个月时出现阴道出血，应及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇应注意休息，避免劳累和性生活，保持心情舒畅，加强营养，按时产检，确保胎儿的健康发育。