奥硝唑主要用于治疗由厌氧菌感染引起的多种疾病。例如，它可用于腹部感染，像腹膜炎、腹内脓肿等；还能用于盆腔感染，比如子宫内膜炎、子宫肌炎、输卵管或卵巢脓肿、盆腔软组织感染、嗜血杆菌阴道炎等；在口腔感染方面，如牙周炎、根尖周炎等也有应用。
腹部感染相关疾病治疗
腹膜炎治疗： 奥硝唑能对引起腹膜炎的厌氧菌发挥作用，帮助控制感染。一般来说，它可以配合其他抗菌药物使用来治疗腹膜炎。腹内脓肿治疗： 对于腹内脓肿这种由厌氧菌感染导致的疾病，奥硝唑能够抑制厌氧菌的生长繁殖，从而促进脓肿的好转。
盆腔感染相关疾病治疗
子宫内膜炎治疗： 当女性因厌氧菌感染患上子宫内膜炎时，奥硝唑可以通过抑制厌氧菌的代谢过程，达到治疗子宫内膜炎的目的。子宫肌炎治疗： 在子宫肌炎的治疗中，奥硝唑能针对厌氧菌感染发挥作用，缓解子宫肌炎带来的炎症症状。
口腔感染相关疾病治疗
牙周炎治疗： 牙周炎常常有厌氧菌参与感染，奥硝唑可以用于牙周炎的辅助治疗，帮助减轻牙周炎引起的牙龈红肿、疼痛等症状。根尖周炎治疗： 对于根尖周炎中由厌氧菌感染导致的情况，奥硝唑能够抑制厌氧菌，进而促进根尖周炎的恢复。