小孩莫名其妙哭闹的原因包括缺乏安全感、身体不适（如消化系统不完善导致肠胃消化不良引起腹痛等）以及缺钙等。具体如下：
一、缺乏安全感。小孩若缺乏安全感，会感到害怕从而出现莫名其妙的哭闹。这时心理上需要安抚以给予安全感，父母应抱起孩子耐心安抚，让宝宝心理上觉得安全踏实，其哭闹便会逐渐平静下来。平常要注意多陪伴孩子。
二、身体不适。小孩身体诸多方面发育尚未完善，尤其是消化系统。若喂养过多或吃了不干净食物，会引发肠胃消化不良，出现胃胀、腹痛等症状，此时小孩就会哭闹。需要帮助小孩按摩腹部，以改善腹部不适症状。
三、缺钙。小孩身体缺钙会有异常表现，缺钙会导致神经兴奋性增高，很容易哭闹，还会出现烦躁不安、睡觉易惊醒以及枕秃等症状。需要及时给予补钙治疗，以维持小孩身体的营养平衡。
总之，当小孩出现莫名其妙哭闹时，要综合考虑可能的原因，采取相应的措施来缓解小孩的不适。