糠秕孢子菌性毛囊炎主要通过抗真菌药物治疗。一般来说，外用抗真菌药物可作为首选，像酮康唑洗剂就有一定效果，使用时需连续用几周。
外用药物选择
酮康唑洗剂： 可以抑制糠秕孢子菌的生长繁殖，使用时要将洗剂涂抹在患处，停留一段时间后再清洗，一般需要连续使用几周时间。联苯苄唑乳膏： 属于外用抗真菌药膏，直接涂抹在毛囊炎的部位，能起到抗真菌的作用，每天使用1 - 2次即可。
口服药物情况
伊曲康唑： 是常用的口服抗真菌药物，对于糠秕孢子菌性毛囊炎有一定疗效，但要注意它可能会对肝脏有一定影响，使用前需要检查肝功能，并且要在医生指导下使用。氟康唑： 也是口服抗真菌药，同样需要在医生评估后使用，它的作用机制是抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。
日常护理要点
保持皮肤清洁： 要经常洗澡，保持皮肤的干爽，洗澡时可以使用温和的沐浴产品，但是不要过度搓洗皮肤，以免损伤皮肤屏障。注意衣物透气： 穿着透气性好的衣物，尤其是贴身的衣物，比如棉质的内衣裤，这样可以减少皮肤局部的潮湿，不利于糠秕孢子菌的生长。避免搔抓： 不要用手去搔抓患处，防止皮肤破损，引发继发感染，加重病情。如果瘙痒明显，可以在医生指导下使用一些止痒的药物。增强免疫力： 平时要注意加强锻炼，合理饮食，保证充足的睡眠，以提高身体的免疫力，有助于病情的恢复和预防复发。比如每天可以进行30分钟左右的有氧运动，饮食上多吃蔬菜水果，保证7 - 8小时的睡眠时间。