预防脑血栓比较有效的药物主要有抗血小板聚集药物和他汀类药物等。一般来说，常用的抗血小板聚集药物如阿司匹林，能抑制血小板的聚集，降低血栓形成的风险，价格相对较为亲民，普通剂型一盒可能几元到十几元不等；而氯吡格雷也是常用的抗血小板药物。他汀类药物如阿托伐他汀等，不仅可以降低血脂，还能稳定斑块，延缓动脉粥样硬化的进展。
抗血小板聚集药物
阿司匹林：它通过抑制环氧化酶，减少血栓素A₂的生成，从而抑制血小板聚集。一般有心血管疾病高危因素的人群可以考虑使用，但有胃肠道疾病的患者要注意可能引起胃肠道不适等副作用，且对阿司匹林过敏者禁用。氯吡格雷：作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林的患者可以选用，但可能会有出血等风险，用药期间需密切观察。
他汀类药物
阿托伐他汀：可以降低血液中的低密度脂蛋白胆固醇（LDL - C）水平，还能稳定动脉粥样硬化斑块，减少斑块破裂的风险，进而降低脑血栓的发生风险。不过，使用过程中要注意监测肝功能等，有严重肝功能不全等情况的患者禁用。瑞舒伐他汀：同样属于他汀类药物，也具有降低血脂、稳定斑块的作用。它的降脂作用相对较强，但也可能存在肌肉疼痛等不良反应的风险，用药时需遵循医嘱。
其他辅助药物
依达拉奉：具有清除自由基、抑制脂质过氧化的作用，可用于改善急性脑梗死患者的神经功能缺损。但它有一定的使用禁忌和注意事项，比如严重肾功能衰竭的患者禁用等。丁苯酞：能够改善脑缺血区的微循环和血流量，促进神经功能恢复。不过，它也有一些不良反应，像可能引起转氨酶轻度升高，用药过程中需要定期监测肝功能等指标。