男性生殖器疱疹主要通过抗病毒药物来控制，常用的有阿昔洛韦等。一般来说，及时用药可以在一定程度上缓解症状、缩短病程。
抗病毒药物选择
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰病毒DNA合成，抑制疱疹病毒复制。可口服，对于初发的生殖器疱疹，一般疗程为7 - 10天。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，起效更快。口服后在体内转化为阿昔洛韦发挥作用，初发患者疗程通常也是7 - 10天。
日常护理要点
保持局部清洁干燥： 要每天用清水清洗生殖器部位，避免感染加重。清洗时动作要轻柔，防止摩擦疱疹导致破裂。比如可以每天用温水轻柔清洗1 - 2次。避免搔抓： 生殖器疱疹会有瘙痒感，但一定要克制，不能用手去搔抓患处，因为搔抓可能会引起疱疹破损，进而引发继发感染，还可能导致疱疹扩散到身体其他部位。
生活方式调整
注意休息： 患病期间要保证充足的睡眠，一般建议每天睡眠时间达到7 - 8小时，让身体有足够的精力来对抗病毒，促进恢复。加强营养： 多吃富含蛋白质、维生素的食物，像鸡蛋、牛奶、新鲜的蔬菜水果等。蛋白质有助于身体修复受损组织，维生素能增强免疫力，比如每天可以吃1 - 2个鸡蛋，适量摄入苹果、菠菜等。避免性生活： 在生殖器疱疹发作期间，一定要避免性生活，防止将病毒传染给性伴侣，而且性生活还可能会刺激患处，加重病情，一般需要等到疱疹完全愈合后再考虑恢复性生活。