灰指甲是由皮肤癣菌等真菌侵犯甲板或甲下所引起的疾病，中医治疗灰指甲有多种方法。一般来说，中医治疗灰指甲可以从外用药物、中药内服以及中医外治等方面入手。
外用药物浸泡法
中药浸泡方： 常见的有选用土茯苓、白鲜皮、地肤子、蛇床子等中药煎水后浸泡灰指甲部位。一般需要每天浸泡1 - 2次，每次浸泡20 - 30分钟左右。这些中药具有一定的抗菌消炎、抑制真菌生长的作用。比如土茯苓，它能解毒、除湿，对于真菌感染有一定的抑制效果；白鲜皮能清热燥湿、祛风解毒，有助于改善灰指甲局部的感染状况。
中药敷贴法
自制敷贴： 可以用一些具有抗真菌作用的中药研磨成粉，再加上适量的醋或者其他介质调成糊状，敷在灰指甲的病甲上。例如将鸦胆子等中药研粉后，用醋调和敷于病甲处，然后用纱布包扎固定。不过在敷贴过程中要注意观察局部皮肤的反应，如果出现过敏等不适情况要及时取下。鸦胆子有清热解毒、截疟、杀虫的功效，对皮肤癣菌等有一定的抑制作用，但使用时要谨慎，避免接触正常皮肤。
中医外治其他方法
手术拔甲配合中药： 对于病情较为严重的灰指甲，有时候可能需要进行手术拔甲，在拔甲后可以配合中医中药的治疗。术后用中药洗剂等清洗创面，促进伤口愈合，同时防止感染复发。手术拔甲后一般需要定期换药等护理，而配合中药可以加速局部组织的修复以及抑制残留真菌的生长。
中药内服调理
辨证用药： 根据患者的整体情况进行辨证论治。如果是脾虚湿盛型，可能会选用健脾利湿的药物，如参苓白术散加减，药物有党参、白术、茯苓、薏苡仁等。这类药物可以从调节身体的整体状态出发，增强机体的抵抗力，从而有助于抑制真菌在指甲部位的生长。因为当人体脾胃功能正常，湿气不盛时，身体的抗病能力相对较强，有利于对抗真菌感染引起的灰指甲问题。如果是肝肾不足型，则会采用补益肝肾的药物，像六味地黄丸加减等，其中的熟地黄、山茱萸等药物可以补益肝肾，改善机体的内环境，辅助治疗灰指甲。