女性怀孕三个月一般不建议药物流产，应及时就医检查并在医生指导下采取人流手术。具体如下：
一、药物流产：主要是通过服用米非司酮片等药物促使子宫收缩，进而将胚胎排出体外，通常适用于妊娠49天以内的女性。而当女性怀孕达3个月时，已不适合进行药物流产。
1.药物流产的原理：利用药物作用引起子宫收缩。
2.适用的妊娠时间范围：49天内。
二、人流手术：是通过人工流产的方式来终止妊娠。但要注意，这种手术对女性身体伤害较大。
1.人流手术的方式：人工操作终止妊娠。
2.术后注意事项：短时间内需适当休息，避免过度劳累。
注意事项：如果女性近期没有怀孕打算，那么在同房期间一定要做好避孕措施，以防意外怀孕带来的一系列问题。总之，对于怀孕后的处理方式要根据具体情况谨慎选择，以保障女性的健康和安全。