无痛胃镜一般是存在副作用的，不过副作用相对较小，主要包括以下这些方面：
一、可能对咽喉部以及消化道黏膜造成损伤。这是因为在进行无痛胃镜检查时，仪器需要通过咽喉部进入消化道，在此过程中可能会对这些部位的黏膜产生一定程度的摩擦或刺激。
二、可能导致患者出现吸入性肺炎，或者引发心脑血管的并发症。进行无痛胃镜检查时，患者处于麻醉状态，其吞咽反射等可能会受到抑制，容易导致口腔分泌物或胃内容物反流进入气管，从而引发吸入性肺炎等问题；同时，麻醉状态以及检查过程中的应激反应等，也可能会对心脑血管系统产生一定影响，增加心脑血管并发症的发生风险。
三、对于过敏体质的患者来说可能存在麻醉风险。因为进行无痛胃镜时需要依据医嘱使用麻醉药物进行麻醉，这类患者可能会出现过敏反应，严重情况下甚至会导致患者无法苏醒。
无痛胃镜指的是在普通胃镜检查前由麻醉医师对患者实施麻醉，让患者迅速进入沉睡状态，以便医师顺利完成胃镜检查。通常在进行无痛胃镜后5-10分钟患者即可苏醒。建议患者在进行无痛胃镜检查后的24小时内避免驾驶、高空作业等，要多加注意休息。
总结：无痛胃镜虽有副作用但较小，包括可能损伤黏膜、引发相关病症及麻醉风险，检查后需注意相关事项。