小儿夜间咳嗽有痰，可通过对因治疗与对症治疗来处理。对因治疗包括针对呼吸道感染、过敏性咳嗽、咳嗽变异性哮喘进行治疗，对症治疗主要针对咳嗽、咳痰症状。
一、对因治疗：
1.呼吸道感染：小儿若发生呼吸道感染，会刺激呼吸道黏膜产生较多分泌物，引发刺激性咳嗽，表现为夜间咳嗽有痰。此时应遵医嘱口服感冒宁糖浆、阿莫西林克拉维酸钾颗粒等药物，以缓解呼吸道感染症状。
2.过敏性咳嗽：若小儿为过敏性体质，可能在夜间接触过敏原而引起过敏性咳嗽，导致夜咳有痰。要及时查明过敏原以便日常避免接触，同时可遵医嘱服用氯雷他定糖浆、盐酸西替利嗪口服溶液等药物进行治疗。
3.咳嗽变异性哮喘：这也是小儿夜间咳嗽较严重的常见病因，病情严重时可出现少量痰液。建议遵医嘱选用丙酸氟替卡松雾化吸入用混悬液等药物进行治疗。
二、对症治疗：
1.咳嗽：若小儿长时间咳嗽，可口服小儿止咳糖浆、枸橼酸喷托维林片等止咳药物来缓解夜间咳嗽情况。
2.咳痰：若小儿痰液较多，可遵医嘱口服乙酰半胱氨酸颗粒进行化痰处理，也可使用吸入用布地奈德混悬液，能有效湿化气道表面，利于排痰。
总之，对于小儿夜间咳嗽有痰的情况，要明确病因后进行针对性治疗，同时根据咳嗽、咳痰等具体症状进行对症处理，以改善小儿的不适。