囊肿型痤疮是比较严重的痤疮类型，治疗方法多样。一般来说，可通过外用药物、口服药物以及物理治疗等方法来改善。
外用药物治疗
维A酸类药物： 像维A酸乳膏就可以使用，它能调节表皮角质形成细胞的分化，改善毛囊皮脂腺导管角化，减少粉刺形成。但使用时要注意，开始使用可能会有轻度刺激反应，如局部红斑、脱屑等，一般坚持使用一段时间后可逐渐耐受。通常建议晚上睡前少量涂抹在痘痘部位。过氧化苯甲酰： 具有抗菌消炎的作用，可缓慢释放新生态氧和苯甲酸，能杀灭痤疮丙酸杆菌。它可以单独使用，也可与维A酸类药物或抗生素类药物联合使用。不过，它可能会使皮肤出现轻度刺激症状，如皮肤干燥、脱屑等，敏感肌肤要慎用。
口服药物治疗
抗生素： 比如四环素类的米诺环素，可抑制痤疮丙酸杆菌的生长繁殖，减轻炎症反应。但要注意，8岁以下儿童一般不建议使用四环素类药物，因为可能会影响牙齿发育。另外，使用这类药物时要严格按照医嘱，不能自行停药或增减剂量。异维A酸： 对于严重的囊肿型痤疮有较好的疗效，它可以减少皮脂腺分泌，抑制痤疮丙酸杆菌生长，调节毛囊皮脂腺导管角化。不过，异维A酸有致畸作用，育龄期男女服药期间及停药后3个月内必须严格避孕，而且使用过程中要定期监测肝功能、血脂等指标。
物理治疗
光动力治疗： 是将光敏剂外用后照射特定波长的光，使皮脂腺萎缩，杀灭痤疮丙酸杆菌，减轻炎症反应。一般需要多次治疗，每次治疗间隔一定时间。治疗后局部皮肤可能会有轻度红肿、疼痛等反应，通常会逐渐缓解。红蓝光治疗： 蓝光可以杀灭痤疮丙酸杆菌，红光可以刺激胶原蛋白产生，减轻炎症。红蓝光治疗一般每次治疗时间较短，相对比较安全，不良反应较少，可能会有治疗部位轻微发热、泛红等情况，大多能自行恢复。囊肿切开引流： 如果囊肿型痤疮的囊肿较大，经上述治疗效果不佳时，可由医生进行囊肿切开引流，将囊肿内的脓液排出，促进愈合，但要注意严格无菌操作，避免感染加重。