宝宝咳嗽有痰总是在睡觉的时候咳，可能是以下原因导致的。
1.生理原因：
宝宝的喉部和气管比较狭窄，咳嗽的反射能力还没有完全发育好，不能及时咳出痰液，因此在睡觉的时候，痰液可能会刺激喉部，引起咳嗽。此外，宝宝在睡眠时，身体的代谢率降低，呼吸道的分泌物也会相对增多，容易导致咳嗽。
2.过敏：
如果宝宝对某些物质过敏，如花粉、尘螨、动物毛发等，在睡觉的时候，可能会因为接触到过敏原而引起咳嗽。
3.呼吸道感染：
呼吸道感染是宝宝咳嗽有痰的常见原因，如感冒、肺炎等。在感染的情况下，呼吸道会分泌大量的痰液，导致咳嗽。
4.卧位不当：
如果宝宝睡觉的姿势不当，如头部过低或过高，可能会导致呼吸道不畅，引起咳嗽。
5.其他：
宝宝在睡觉前吃得过饱、过咸，或者患有胃食管反流病等，也可能会引起咳嗽。
针对宝宝咳嗽有痰总是在睡觉的时候咳的情况，可以采取以下措施。
1.保持室内空气湿润：
可以使用加湿器增加室内空气的湿度，有助于缓解咳嗽。
2.调整宝宝的睡姿：
可以将宝宝的头部垫高一些，或者让宝宝侧卧睡觉，有助于保持呼吸道通畅。
3.给宝宝拍背：
在宝宝咳嗽时，可以轻轻拍打其背部，帮助痰液咳出。
4.多给宝宝喝水：
多喝水有助于稀释痰液，促进痰液咳出。
5.避免过敏原：
如果宝宝对某些物质过敏，应尽量避免接触过敏原。
6.及时就医：
如果宝宝咳嗽有痰的情况持续时间较长，或者伴有其他症状，如发热、呼吸急促等，应及时就医，以便明确病因，并进行相应的治疗。
需要注意的是，在给宝宝使用药物治疗时，应在医生的指导下使用，避免自行用药。同时，应注意观察宝宝的病情变化，如有异常应及时就医。