阴茎痛的原因包括尿道炎、尿道结石、阴茎硬结症等，具体情况如下：
一、尿道炎：若是尿道炎引发的阴茎疼痛，往往伴有排尿异常状况，比如尿频、尿急、尿痛等。这时需要进行尿常规和尿培养检查，以确定是否存在尿道感染。尿道炎主要是由于细菌等病原体感染尿道所致，当炎症刺激尿道时，就可能导致阴茎出现疼痛。
二、尿道结石：尿道结石通常会导致持续性的阴茎疼痛，且伴有排尿困难、排尿分叉、无法排尿等排尿异常表现。可通过尿道镜检查来明确尿道内是否有结石存在。尿道结石可能是由于肾脏或膀胱内的结石排入尿道，或者在尿道内形成并逐渐增大引起的。
三、阴茎硬结症：这是指阴茎海绵体白膜发生纤维化病变，使阴茎部位出现硬结，患者常在勃起时感到疼痛，甚至可能出现阴茎弯曲、阴茎缩小等症状。其具体病因尚不完全清楚，可能与遗传、创伤、炎症等多种因素有关。
建议患者一旦出现阴茎痛应尽快前往医院，进行相关检查以明确诊断，避免延误病情。