血HCG偏低可能由多种原因引起。一般来说，怀孕早期血HCG偏低，可能是胚胎发育异常，比如受精卵着床较晚，通常在受孕后10 - 14天左右测血HCG，如果着床晚，可能数值相对偏低；也可能是宫外孕，宫外孕时胚胎发育不良，血HCG升高缓慢，数值较正常妊娠偏低。
受精卵着床因素
着床时间差异： 如果女性月经周期不规律，比如月经周期较长，达到35天甚至更久，那么受精卵着床时间就会相对较晚，这时候测血HCG就可能出现偏低的情况。一般受孕后10 - 14天，正常妊娠血HCG会有一定数值范围，而着床晚的话，数值会低于同期正常妊娠的水平。胚胎质量问题： 即使受精卵着床时间正常，但如果胚胎本身质量不佳，比如染色体存在异常等情况，也会导致血HCG分泌不足，出现偏低现象。这种情况下，胚胎往往难以正常发育，后续可能会发生自然流产等情况。
内分泌因素
黄体功能不全： 黄体分泌的孕酮等激素对维持妊娠至关重要，若黄体功能不全，分泌的激素水平不足，就会影响胚胎的着床和发育，进而导致血HCG偏低。女性体内的孕激素水平如果长期处于较低状态，就会不利于胚胎生长，使得血HCG上升缓慢或数值偏低。甲状腺功能异常： 甲状腺分泌的激素对人体的代谢等多种功能有调节作用，当甲状腺功能减退时，会影响身体的整体代谢及内分泌环境，可能导致血HCG偏低。甲状腺功能减退的女性，身体的各项生理活动可能会受到不同程度的影响，包括与妊娠相关的激素调节，从而出现血HCG异常情况。
宫外孕因素
胚胎着床位置异常： 宫外孕是指受精卵在子宫体腔以外着床，常见的是输卵管妊娠。由于输卵管的环境不利于胚胎正常发育，胚胎获取营养受限，所以分泌的血HCG量相对较少，导致血HCG数值偏低。例如，输卵管管腔较窄，随着胚胎的生长，会引起输卵管妊娠破裂等严重后果，而在早期就表现为血HCG低于正常宫内妊娠水平。宫外孕发展阶段： 在宫外孕早期，胚胎还比较小，分泌的血HCG量不多，所以血HCG数值会偏低。随着宫外孕的进展，可能会出现腹痛、阴道流血等症状，但早期仅通过血HCG检测就可能发现数值偏低的情况，需要进一步通过超声等检查来明确诊断。