咽鼓管阻塞最常导致中耳积液，约有60%以上的分泌性中耳炎与咽鼓管阻塞相关。
引发听力下降
咽鼓管阻塞会使中耳内的气压发生变化，影响声音的传导。患者会感觉耳朵闷堵，听力逐渐下降，尤其是在说话时可能会感觉自己的声音异常响亮（自听增强），这种情况在儿童中较为常见，约30%的儿童分泌性中耳炎是由咽鼓管阻塞引起听力下降导致学习受影响。
导致耳鸣
咽鼓管阻塞还常常引发耳鸣，表现为耳内出现持续或间断的嗡嗡声、吹风声等异常声响。一般来说，约40%的咽鼓管阻塞患者会伴有耳鸣症状，而且耳鸣可能会在吞咽、打哈欠时有所变化。
引起耳部闷胀感
患者会明显感觉到耳朵有闷胀感，就像耳朵被什么东西堵住了一样。这种闷胀感会随着咽鼓管阻塞程度的变化而时轻时重，大约70%的咽鼓管阻塞患者会出现耳部闷胀感的症状，严重时会影响日常的生活和工作，比如在乘坐飞机时这种闷胀感可能会加重。
增加中耳感染风险
由于咽鼓管阻塞，中耳内的分泌物无法正常排出，容易滋生细菌等病原体，从而增加中耳感染的风险。一旦发生中耳感染，可能会出现耳朵疼痛、发热等症状，如果不及时治疗，感染可能会进一步加重，甚至可能导致鼓膜穿孔等严重并发症，约20%的咽鼓管阻塞患者会因为分泌物积聚等原因继发中耳感染。