直肠粘膜局部管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变的治疗方法主要包括以下几种：
1.内镜下切除：对于较小的管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变，可通过内镜下切除的方法进行治疗，如电切、圈套切除等。这种方法创伤小、恢复快，但需要注意切除的彻底性，以避免复发。
2.手术治疗：对于较大或内镜下切除不彻底的管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变，可能需要进行手术治疗，如直肠系膜切除术、经肛局部切除术等。手术治疗的范围较大，创伤也相对较大，但可更彻底地切除病变组织。
3.定期复查：对于已经接受治疗的患者，需要定期进行复查，包括结肠镜检查、组织病理学检查等，以监测病情的变化，及时发现复发或进展。
需要注意的是，直肠粘膜局部管状腺瘤伴低级别上皮内瘤变的治疗方法应根据患者的具体情况进行选择，如病变的大小、位置、患者的年龄、健康状况等。在治疗过程中，患者应积极配合医生的治疗，注意饮食调整、保持良好的生活习惯，以提高治疗效果和预防复发。