不同类型的结膜炎需选用不同类型的眼药水或眼膏来治疗，所以不存在哪种眼药水是最好的这一说法。
眼药水是治疗结膜炎的关键药物，需经医生明确结膜炎的类型后进行恰当选用。
一、细菌性结膜炎：可使用抗生素类眼药水。在病原学结果出来前，可在医生指导下先局部应用广谱抗生素，比如左氧氟沙星、妥布霉素眼药水等；确定病原体后运用敏感抗生素，能有效缩短病程，症状通常可在1周左右消失，且副作用较小。病情严重或是特殊致病菌感染时，可选择全身用药以及联合用药。
二、病毒性结膜炎：需选择局部使用含有抗病毒药物的眼药水，像更昔洛韦或阿昔洛韦眼药水等。部分患者可考虑在医生指导下局部使用糖皮质激素，一旦炎症消退，应逐渐减少使用。
三、过敏性结膜炎：常用人工泪液来稀释过敏原，还可使用抗组胺药、肥大细胞稳定剂、糖皮质激素以及非甾体类消炎药的眼药水来减轻眼部症状，严重者需加用全身抗过敏药物。糖皮质激素眼药水能有效缓解症状，在病情控制后要逐渐减少眼药水的使用频率，不可突然停药。
四、衣原体性结膜炎：可局部使用新霉素、红霉素或四环素类眼药水或眼膏。急性期或严重患者通常需要全身应用抗生素治疗。需注意，7岁以下儿童和孕妇忌用四环素，成年人和8岁以上儿童一般选用阿奇霉素或多西环素，孕妇用药则须依据医生建议。
结膜炎是由微生物（病毒、细菌、衣原体等）感染、外界刺激（物理刺激、化学损伤）以及过敏反应等引发的结膜炎症，常被称为“红眼病”。除了局部用药外，日常还应注意眼部卫生，勿用手揉眼睛，使用滴眼液前要洗净双手；通过锻炼身体、加强营养来增强抵抗力；戴角膜接触镜的患者应强化接触镜护理，缩短佩戴时间，急性发病期应停戴接触镜；角膜炎患者应尽量避免食用会加重过敏的食物，如海鲜类、辛辣刺激性食物、鱼蛋虾食物等。
总之，针对不同类型的结膜炎要选择合适的治疗方法和药物，同时注意日常眼部护理和生活习惯，以促进病情的恢复和预防复发。