男生小便时尿道刺痛，可能与以下因素有关：
1.尿道炎：
尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、支原体、衣原体等感染引起。除了尿道刺痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。
2.前列腺炎：
前列腺炎是前列腺的炎症，常见于中青年男性。除了尿道刺痛，还可能伴有会阴部、耻骨上区、腹股沟区等部位的疼痛，以及尿频、尿急、尿痛、尿不尽等症状。
3.膀胱炎：
膀胱炎是膀胱的炎症，也可导致尿道刺痛，同时可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
4.尿道结石：
尿道结石可导致尿道黏膜损伤，引起尿道刺痛，还可能伴有排尿困难、血尿等症状。
5.其他原因：
尿道损伤、尿道狭窄、尿道口息肉等也可能导致尿道刺痛。
需要注意的是，尿道刺痛可能是一种症状，而不是一种独立的疾病。如果出现尿道刺痛，建议及时就医，进行相关检查，如尿液检查、前列腺液检查、超声检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，避免食用辛辣刺激性食物。