黑枸杞与红枸杞在外观、营养成分及功效等方面存在差异。外观上黑枸杞果实呈黑色或紫黑色，红枸杞多为红色。
一、营养成分差异
黑枸杞中花青素含量相对较高，花青素具有抗氧化等作用；红枸杞富含胡萝卜素等，胡萝卜素在体内可转化为维生素A，对视力等有一定益处。
二、功效侧重点
黑枸杞在抗氧化、改善血液循环等方面可能有一定优势；红枸杞在滋补肝肾、明目等传统功效上更为人们熟知。
三、食用方式
两者均可直接食用、泡水等，但黑枸杞泡水时水温不宜过高，以免破坏营养成分；红枸杞相对来说对水温要求没那么严苛。
四、适用人群
一般健康人群均可适量食用，但对于有特殊疾病史的人群，如糖尿病患者需注意黑枸杞或红枸杞中的糖分影响，应在医生指导下食用，孕妇等特殊人群也需谨慎选择食用。