下身（生殖器）在上厕所时刺痛，可能与以下原因有关：
1.尿道炎：
感染：尿道炎是泌尿系统最常见的疾病。女性尿道炎常与阴道炎、宫颈炎并存。尿道炎主要是由淋球菌、类淋球菌、支原体、衣原体、白色念珠菌、毛滴虫等致病菌感染引起。
症状：尿频、尿急、尿痛是尿道炎的主要症状，有时还会伴有血尿。尿道炎可分为急性和慢性两种，急性尿道炎通常会出现较多尿道分泌物，慢性尿道炎则分泌物较少，排尿刺痛。
2.膀胱炎：
感染：膀胱炎是一种常见的尿路感染，主要由细菌感染引起。膀胱炎可分为急性和慢性两种，急性膀胱炎发病急，症状明显，慢性膀胱炎症状相对较轻。
症状：膀胱炎的主要症状是尿频、尿急、尿痛，有时还会伴有下腹部疼痛和血尿。
3.阴道炎：
感染：阴道炎是妇科常见疾病，可由细菌、真菌、滴虫等感染引起。不同类型的阴道炎症状相似，主要表现为阴道分泌物异常、瘙痒、异味和性交痛，有时也会出现排尿疼痛。
治疗：阴道炎的治疗方法因病因不同而异。一般来说，治疗方法包括外用药物、口服药物和局部冲洗等。
4.其他：
尿道口炎：尿道口炎是尿道口黏膜的炎症，常由细菌感染引起。尿道口炎的主要症状是尿道口红肿、疼痛、排尿困难，有时还会伴有分泌物。
尿道结石：尿道结石是泌尿系统的常见疾病，结石可导致尿道黏膜损伤，引起排尿疼痛。尿道结石还可能导致排尿困难、尿潴留等症状。
如果下身（生殖器）在上厕所时刺痛，建议及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免不洁性行为。