丛集性头痛发作时可通过药物缓解，急性期常用舒马曲坦，能收缩血管缓解疼痛，一般在头痛发作早期使用效果较好。
急性发作期的药物选择
舒马曲坦：属于5-羟色胺受体激动剂，能特异性作用于颅内血管及三叉神经系统，收缩扩张的血管，从而缓解丛集性头痛的疼痛症状，通常在头痛刚开始发作时使用效果最佳。佐米曲普坦：也是5-羟色胺受体激动剂，作用机制与舒马曲坦类似，对丛集性头痛的急性发作有缓解作用，可在头痛发作时按需服用。
预防性治疗药物
维拉帕米：是常用的预防性治疗药物之一，一般从小剂量开始使用，比如初始剂量可以是40毫克，每天3次，然后根据患者的反应和耐受性逐渐调整剂量，但需监测血压等指标。锂剂：对于部分难治性丛集性头痛患者可能有效，不过使用时需要密切监测血锂浓度，一般治疗剂量范围在0.6~1.2毫摩尔/升之间，要注意避免锂中毒。
生活方式的调整
避免诱因：丛集性头痛患者要尽量避免已知的诱因，比如酒精，饮酒可能会诱发丛集性头痛发作，所以要严格限制酒精摄入；还要避免吸烟，烟草中的某些成分也可能触发头痛。规律作息：保持规律的作息时间很重要，每天尽量在相同的时间睡觉和起床，保证充足的睡眠时间，一般成年人需要7~8小时的睡眠时间，良好的睡眠有助于减少丛集性头痛的发作频率。环境调整：创造一个安静、舒适、黑暗的休息环境也有帮助，当头痛发作时，在这样的环境中休息可能会缓解不适。
其他辅助措施
氧疗：在丛集性头痛发作时进行氧疗也有一定效果，一般是吸入100%的纯氧，流量为7~10升/分钟，持续10~15分钟，部分患者通过氧疗可以减轻头痛程度。针灸辅助：针灸对于丛集性头痛可能有一定的辅助治疗作用，通过刺激特定的穴位来调节身体的气血等，不过需要由专业的针灸医师进行操作，并且要坚持治疗才能可能看到效果。