一代试管婴儿和二代试管婴儿主要有以下区别。一代试管婴儿又称体外受精-胚胎移植技术（IVF-ET），二代试管婴儿又称卵胞浆内单精子显微注射技术（ICSI）。一代试管婴儿的费用相对二代试管婴儿略低，一般一代试管婴儿的费用大概在2-3万元左右，二代试管婴儿费用可能在3-5万元左右。
适用人群方面
一代试管婴儿适用人群：主要适用于女性输卵管因素导致的不孕，比如输卵管堵塞、输卵管粘连等影响精子和卵子结合的情况；还有一些原因不明的不孕症，以及子宫内膜异位症经药物或手术治疗后仍未妊娠的情况等。二代试管婴儿适用人群：主要针对男性因素导致的不育，像严重少精、弱精、畸精症，或者是男方梗阻性无精子症，通过睾丸或附睾穿刺能获取精子的情况；还有一些常规体外受精失败的情况，也可以考虑二代试管婴儿技术。
操作过程方面
一代试管婴儿操作过程：是将精子和卵子取出后，放在同一培养皿中，让它们自然结合受精，形成胚胎后再移植到女性子宫内。二代试管婴儿操作过程：则是在显微镜下，用特殊的显微操作技术，直接将单个精子注射到卵子内使其受精，然后再进行胚胎移植。
胚胎选择方面
一代试管婴儿胚胎选择：主要是根据胚胎自然受精后的发育情况等来选择优质胚胎进行移植。二代试管婴儿胚胎选择：同样也是依据胚胎的质量来选择，但由于是单精子注射，在一定程度上可能会减少一些因为精子问题导致的胚胎异常情况，但主要还是基于胚胎自身的发育潜力等因素来挑选优质胚胎移植。