怀孕三个月时的流产方式主要有以下几种：
一、药物流产加清宫手术：可遵医嘱服用米非司酮或米索前列醇等药物，米非司酮能将胚胎杀死，米索前列醇可促进子宫收缩，使得胚胎和胎盘逐渐排出，同时需及时进行清宫手术，把残留物质清理干净，以此达到流产目的。
二、引产：此时胎儿已逐渐发育长大且有明显骨骼，可采用引产方式流产，较为彻底。引产方法主要包括：
1.药物引产：如利凡诺引产。
2.钳刮术。
流产后的注意事项：在流产后1个月内要多休息，可适当活动，但不能剧烈运动，禁止性生活，避免劳累、熬夜等。饮食方面要保持清淡，避免食用辛辣刺激食物，以防影响病情恢复。
总之，怀孕三个月流产的方式需根据具体情况选择，流产后要做好各方面的护理，促进身体恢复。