肛门闭锁手术并无固定的最佳时期，这主要取决于肛门闭锁的位置差异，需依据具体状况来选定适宜的手术时间与手术方式。具体如下：
一、若是存在直肠前庭瘘、会阴瘘或者低位无漏肛门闭锁的情形，那么在肛门闭锁确诊后应即刻进行手术，通常这类手术会在新生儿出生后的1至2天内完成。
1.直肠前庭瘘：是一种肛门闭锁伴有的瘘管情况。
2.会阴瘘：也是肛门闭锁可能出现的瘘管类型。
3.低位无漏肛门闭锁：这种情况下需要尽快手术处理。
二、若为中位闭锁或高位闭锁，则往往需要先做临时造瘘手术，可等待三个月左右再进行根治性手术。较为常用的手术方式包含经会阴肛门成形术、后矢状入路肛门直肠成形术，或者腹腔镜辅助下骶会阴肛门成形术等。
1.经会阴肛门成形术：是一种有效的手术方式。
2.后矢状入路肛门直肠成形术：在这类手术中应用较多。
3.腹腔镜辅助下骶会阴肛门成形术：借助腹腔镜技术来进行手术。
做完手术后，要密切留意新生儿的各项生命体征，及时查看其身体状态，扎实做好术后护理工作，以防止术后感染情况的发生。待身体完全恢复后，还需要进行排便训练，建议选择固定时间排便，排便时不可受外界干扰，且要确保排便通畅。
总之，肛门闭锁手术需根据具体情况选择合适时机与方式，术后护理和排便训练也至关重要。